
定點突變
目前,由PCR介導(dǎo)的定點突變相比于其他突變技術(shù)具有周期短、成功率高、不受酶切位點限制等優(yōu)點,是使用最普遍的定點突變方法。
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2025-12-07 03:31:43
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2025-12-03 19:15:06
實驗介紹
【技術(shù)原理】
DNA分子中由于發(fā)生堿基對的增添、缺失或改變進而引起基因結(jié)構(gòu)的改變,稱為基因突變。定點突變 (mutagenesis)是通過PCR等方法向目的DNA片段中引入突變,包括堿基的添加、刪除、點突變等。該技術(shù)能迅速、高效地改變DNA所表達的目的蛋白的性狀及表征,是研究蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能之間復(fù)雜關(guān)系的有力工具,也是研究人員在實驗室中改造、優(yōu)化基因常用的一種非常有用的手段。目前,由PCR介導(dǎo)的定點突變相比于其他突變技術(shù)具有周期短、成功率高、不受酶切位點限制等優(yōu)點,是使用最普遍的定點突變方法。
【實驗流程】

案例展示

常見問題
常見問題1:質(zhì)粒模板無法正常擴增
可能原因及解決方法:
(1)引物設(shè)計有誤:核對引物設(shè)計方案;
(2)擴增體系配制錯誤:重復(fù)實驗;
(3) 擴增反應(yīng)條件不優(yōu)化:調(diào)整Mg濃度、酶量、擴增程序;
(4)模板質(zhì)粒質(zhì)量偏差:長期放置、反復(fù)凍融會導(dǎo)致模板質(zhì)粒斷裂、開環(huán)或降解,應(yīng)使用新鮮制備的質(zhì)粒作為模板。
常見問題2:平板上長不出克隆或克隆數(shù)目很少
可能原因及解決方法:
(1)感受態(tài)效率低:使用新制備或妥善凍存的感受態(tài)細胞,確保轉(zhuǎn)化效率>cfuμg。每次可設(shè)置一組轉(zhuǎn)化質(zhì)粒的對照實驗,以檢測感受態(tài)細胞的轉(zhuǎn)化效率;
(2)重組反應(yīng)體系中DNA量不足,或者比例不佳(雙堿基突變):盡量按照推薦DNA的量配制反應(yīng)體系;
(3) 重組環(huán)化反應(yīng)體系中DNA不純,抑制反應(yīng):未純化DpnI消化產(chǎn)物加入重組反應(yīng)體系內(nèi)的總體積不應(yīng)超過μl(反應(yīng)體系體積)。嘗試對DpnI消化產(chǎn)物進行膠回收純化;
(4)感受態(tài)細胞中加入了過多的反應(yīng)產(chǎn)物:反應(yīng)產(chǎn)物的轉(zhuǎn)化體積不應(yīng)超過感受態(tài)細胞體積的,否則會降低轉(zhuǎn)化效率;
(5)出現(xiàn)轉(zhuǎn)化抑制效應(yīng):當(dāng)轉(zhuǎn)化的DNA濃度太高時,會抑制轉(zhuǎn)化反應(yīng)。將重組反應(yīng)產(chǎn)物稀釋倍后取進行轉(zhuǎn)化。
常見問題3:定點突變未正確完成
可能原因及解決方法:
(1)引物設(shè)計錯誤:核對引物設(shè)計方案;
(2)擴增反應(yīng)所用模板為非甲基化的質(zhì)粒:DpnI只能識別甲基化DNA,請務(wù)必使用從甲基化酶無缺陷的宿主菌中擴增的質(zhì)粒作為PCR模板;
(3)擴增反應(yīng)使用過多的模板質(zhì)粒:對于大多數(shù)質(zhì)粒,ng模板量已足以使擴增反應(yīng)正常進行,過多的質(zhì)粒模板將會導(dǎo)致DpnI消化不完全,降低突變成功率。
常見問題4:非目標(biāo)位點突變
可能原因及解決方法:
(1)模板質(zhì)粒攜帶未知位點突變:測序確認模板質(zhì)粒序列正確性。
(2)擴增循環(huán)數(shù)過多:為了防止擴增過程中引入非目標(biāo)突變,擴增循環(huán)數(shù)不宜超過30。如果擴增效率良好的話,推薦擴增循環(huán)數(shù)應(yīng)不超過35。
送檢與交付標(biāo)準
| 樣品類型 | 樣品需求 | 保存條件 | 運輸條件 | 備注 |
|---|---|---|---|---|
| 動物組織 | 單個樣品>0.1g,2mlEP管或凍存管裝,不要過量;樣本應(yīng)盡量新鮮,如不能立即提取蛋白或核酸,應(yīng)液氮速凍后凍存于-80℃或更低,凍存樣本避免反復(fù)凍融以致降解 | -80℃ | 干冰 | 所有樣本均須有唯一標(biāo)記,且標(biāo)記清晰可識 |
| 種子樣本 | 去殼新鮮或保存于液氮中的的種子樣本,單個樣品>0.2g。 | -80℃ | 干冰 | |
| 貼壁/懸浮細胞 | 1. 總RNA或蛋白:106cell/指標(biāo)、漿/核RNA或蛋白:107cell/指標(biāo)、線粒體RNA或蛋白:2*107 cell/指標(biāo),樣本盡量新鮮,細胞收取后直接加Trizol(QPCR檢測)或直接凍存于-80℃ 2. 若細胞處理(加藥、轉(zhuǎn)染、感染)后狀態(tài)差應(yīng)酌情加大收樣量 | -80℃ | 干冰 | |
| 全血/血清樣品 | 用抗凝管保存的外周血 5~10ml,骨髓 1~3ml; -80℃保存不超半周的白細胞勻漿>400μl,每 400μl 加入 400μl Trizol。 | -80℃ | 干冰 | |
| 石蠟包埋樣品 | 由標(biāo)準的石蠟包埋盒包埋的石蠟塊,有效厚度大于 0.1cm; 新鮮的 FFPE 組織切片,每片厚度不超過 10μm,2~8 張,表面積不超過 250mm2。 | -20℃ | 冰袋 | |
| 抗體 | 1. 按樣本種屬提供滿足相應(yīng)實驗要求的抗體; 2. 按抗體說明書要求寄送,盡量避免分裝;如分裝,確保量足夠進行實驗,并提供抗體說明書。 3.保存抗體的抗體管上應(yīng)有能夠識別此抗體的標(biāo)記,抗體的量應(yīng)大于實驗所需的量。 | -20℃ | 冰袋 | |
| 引物 | 干粉,≥1OD,如進行預(yù)實驗,每個基因至少提供兩對引物, 附帶公司引物合成單。 | -20℃ | 冰袋或常溫 |
